Ο Θουκυδίδης αναγνωρίζεται ως ένας από τους πρώτους ιστορικούς της ανθρωπότητας.
Με την εισαγωγή της μεθόδου της ιστορικής αιτιότητας, δηλαδή της αναζήτησης των βαθύτερων αιτιών ενός γεγονότος, υπήρξε ο πρώτος που προσέγγισε με επιστημονικό τρόπο την ιστορία. Συμβουλευόταν σε μεγάλο βαθμό γραπτά ντοκουμέντα και συνομιλούσε με ανθρώπους που συμμετείχαν ή και πρωταγωνίστησαν στα γεγονότα τα οποία περιέγραφε.
Η σειρά, στην οποία περιλαμβάνονται το αρχαίο κείμενο, νεοελληνική απόδοση και σχολιασμός, αποτελείται από 8 τόμους:

- Άπαντα 1 - Ιστοριών Α': Αναφορά στην προ του Πελοποννησιακού πολέμου ιστορία της Ελλάδας -  Η πολιτική κατάσταση - Αίτια και αφορμές του πολέμου - Τα γεγονότα στην Επίδαμνο και την Ποτείδαια -  Συνέδρια της Σπάρτης.
- Άπαντα 2 - Ιστοριών Β': Τα τρία πρώτα χρόνια του πολέμου - Επιτάφιος λόγος του Περικλή -  Λοιμός στην Αθήνα - Πολιορκία των Πλαταιών.
- Άπαντα 3 - Ιστοριών Γ': Τα γεγονότα μέχρι το 425 π.Χ. Αποστασία Λέσβου - Άλωση Πλαταιών -  Εκστρατεία του Δημοσθένη.
- Άπαντα 4 - Ιστοριών Δ': Τα γεγονότα του 7ου, 8ου και 9ου έτους του πολέμου - Κατάληψη της Σφακτηρίας - Κατάληψη της Αμφίπολης - Βρασίδας.
- Άπαντα 5 - Ιστοριών Ε': Θάνατος του Κλέωνα - Νικίειος ειρήνη - Τα γεγονότα μέχρι το 415 π.Χ.  - Οι Αθηναίοι εκστρατεύουν στη Μήλο.
- Άπαντα 6 - Ιστοριών ΣΤ': Η Σικελική εκστρατεία -  Η απόφαση, οι πολιτικές ζυμώσεις και διαφωνίες στην Αθήνα.
- Άπαντα 7 - Ιστοριών Ζ': Συνέχεια της Σικελικής εκστρατείας - Καταστροφή του στρατού και του στόλου των Αθηναίων.
- Άπαντα 8 - Ιστοριών Η': Οι συνέπειες της Σικελικής εκστρατείας για την Αθήνα - Η εγκαθίδρυση του ολιγαρχικού καθεστώτος στην πόλη το 411 π.Χ. - Τα γεγονότα μέχρι το έτος αυτό -  Ανάκληση του Αλκιβιάδη.